大鹏新区妇幼保健院始建于1958年,是一所由政府举办的非盈利性二级公立医院,承担辖区基本医疗及妇幼健康管理职能,拥有妇科、儿童康复科2个区级重点学科,成立了妇科、妇产科、新生儿科、儿科、儿童康复科、儿童保健科、眼科、超声科、呼吸科、内分泌科、产前诊断及盆底超声等11个名医工作室,于2017年6月加入深圳市首家“市级医院——区级医院——社康机构”三级联动的整合式医疗健康集团,成为大鹏新区医疗健康集团的成员单位和牵头单位深圳市第二人民医院分院;2018年7月依托深圳市政府“医疗卫生三名工程”引进复旦大学附属儿科医院王艺教授儿童神经康复专业团队;2019年7月加入深圳市妇幼保健院牵头组建的深圳市辅助生殖专科联盟;2019年12月与深圳市儿童医院开展儿童康复战略合作;2020年12月与全国首家康复医学院——佳木斯大学康复医学院合作开展康复协作;2021年5月与深圳市妇幼保健院开展自闭症诊疗康复专科联盟合作;2023年11月与中山医院王世宣教授团队合作开展全国“两癌”筛查及“十四五”女性生殖健康重点研发计划项目;2023年12月被认定为“广东省普通高等医学教育一类实习医院”;2024年5月加入深圳市妇幼保健机构联合体。